Усилиями группы специалистов под руководством Петра Черепанова (Peter Cherepanov) из Имперского колледжа Лондона удалось вырастить кристаллическую форму интегразы ВИЧ. Этот фермент играет ключевую роль в процессе включения генного кода вируса в хромосому клетки-хозяина.
АнтиВИЧ-препараты последнего поколения основываются именно на блокировании интегразы, но до сих пор учёные не понимали в полной мере механизм взаимодействия фермента и клетки. В течение многих лет они пытались получить белок в кристаллической форме, чтобы его можно было изучить посредством рентгеноструктурного анализа.
Для нового исследования команда Черепанова вырастила кристалл на основе интегразы, заимствованной из другого ретровируса — PFV (Prototype Foamy Virus), также известного как пенный вирус человека. Предварительные опыты показали, что структура ферментов обоих вирусов должна быть практически идентичной.
За четыре года было предпринято порядка 40 тысяч попыток получения кристалла, из которых успешными оказались лишь семь, а пригодной для анализа – и вовсе одна. Изучив полученный кристалл при помощи сверхмощного синхротрона Diamond Light Source, учёные не пожалели о затраченных усилиях — структура интегразы ВИЧ оказалась совсем не такой, как её представляли исследователи. 3D-ролик, демонстрирующий, что получилось в итоге, можно посмотреть в пресс-релизе колледжа.
Группа Черепанова уже успела изучить взаимодействие интегразы с некоторыми медицинскими препаратами, ингибирующими её активность, и ожидается, что в скором времени их эффект можно будет существенно увеличить. Более подробно о результатах исследования можно узнать в статье, опубликованной в Nature.
Ранее мы рассказывали о расшифровке геномов ВИЧ и крупном прорыве в создании вакцины от СПИДа, а также об открытии путей атаки на мутировавшие разновидности ВИЧ.
